只能通过商业贷款或其他方式在东莞购房，届时去深圳公积金中心申请提取

按照你的描述，你应该是在深圳缴存住房公积金，打算到东莞购房。
那么，你既无法申请深圳的公积金贷款（因为贷款只能用于购买本市住房，而且好像目前深圳尚未开展公积金贷款业务），也无法申请东莞的公积金贷款（因为你不在东莞缴存公积金，虽然有珠三角八市互贷政策，但这八市不包括深圳）。
所以估计你只能通过商业贷款或其他方式在东莞购房，届时去深圳公积金中心申请提取。